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首頁(yè)-技術(shù)服務(wù) > BD Rhapsody單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái) > -單細(xì)胞3‘轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
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    BD Rhapsody單細(xì)胞3‘轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

     

    產(chǎn)品簡(jiǎn)介

     

    單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序如何進(jìn)行單細(xì)胞的捕獲,是決定單細(xì)胞檢測(cè)成本和通量的關(guān)鍵步驟。高通量單細(xì)胞捕獲目前主流的有兩大策略,一種是以10x Genomics為代表的采用微流控芯片技術(shù)(Microfluidic) ,另一種,就是BD Rhapsody為代表的采用微孔板(Microwell) 技術(shù)。 BD Rhapsody單細(xì)胞分析系統(tǒng)包括BD Rhapsody卡式芯片、 BD Rhapsody上樣臺(tái)、 BD Rhapsody掃描儀三大部分。

     

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    BD Rhapsody上樣臺(tái)(左); BD Rhapsody卡式芯片(中); BD Rhapsody掃描儀(右)

     

     

    技術(shù)原理

     

    BD RhapsodyTM 卡式芯片由上萬(wàn)個(gè)微孔組成,主要承擔(dān)樣本以及試劑的添加,在平面卡式芯片上,一個(gè)細(xì)胞與一個(gè)條碼標(biāo)記微球(beads) 依次落入同一個(gè)微孔中,細(xì)胞裂解釋放mRNA并且與磁珠上的引物序列雜交,進(jìn)而完成細(xì)胞的捕獲和mRNA反轉(zhuǎn)錄。磁性回收beads,抓取cDNA進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建并測(cè)序。接下來(lái)采用BD RhapsodyTM 單細(xì)胞分析系統(tǒng)進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,一次可以獲得100~10,000個(gè)單細(xì)胞的基因表達(dá)數(shù)據(jù),實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞水平鑒定和表征細(xì)胞類(lèi)型的目的。

     

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    BD Rhapsody 微孔捕獲及標(biāo)記細(xì)胞原理

     

     

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    BD Rhapsody 單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)流程圖

     

     

    BD Rhapsody 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

     

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    結(jié)果展示

     

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    細(xì)胞分群圖(左); 蛋白表達(dá)密度分布圖和熱圖分析(右)

     

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    Marker 基因聚類(lèi)熱圖(左); 基因表達(dá)擬時(shí)間分析(右)

     

    產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)

     

    超高通量

    每個(gè)樣可檢測(cè)100-10,000個(gè)細(xì)胞;

     

    多組學(xué)檢測(cè)

    可以同時(shí)實(shí)現(xiàn)靶向mRNA+ 蛋白質(zhì)+ VDJ CDR3的單細(xì)胞多組學(xué)研究;

     

    系統(tǒng)可靠

    可利用成像系統(tǒng)對(duì)單細(xì)胞捕獲過(guò)程進(jìn)行質(zhì)控;單細(xì)胞捕獲效率高達(dá)80%,多細(xì)胞比例<1%(1,000個(gè)細(xì)胞中);

     

    經(jīng)驗(yàn)豐富

    百奧醫(yī)藥技術(shù)團(tuán)隊(duì)現(xiàn)已累積100余種不同組織類(lèi)型、數(shù)千余個(gè)樣品的單細(xì)胞測(cè)序經(jīng)驗(yàn)。

     

    送樣要求

     

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    應(yīng)用方向

     

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    應(yīng)用案例

     

    鼻纖毛細(xì)胞是COVID-19早期SARS-CoV-2復(fù)制的主要靶細(xì)胞

    Nasal ciliated cells are primary targets for SARS-CoV-2 replication in the early stage of COVID-19

    發(fā)表雜志:Journal Of Clinical Investigation (IF: 14.808); 發(fā)表時(shí)間: 2021年 7月; 應(yīng)用技術(shù):BD Rhapsody單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

     

    在COVID-19的早期階段,上呼吸道會(huì)受到損害,但在細(xì)胞水平上對(duì)SARS-CoV-2的趨向性尚未完全確定。最近的單細(xì)胞RNA-Seq分析顯示所有鼻上皮細(xì)胞中SARS-CoV-2進(jìn)入相關(guān)宿主分子的mRNA表達(dá)水平較低,但本研究發(fā)現(xiàn)這些蛋白水平相對(duì)較高,并且它們的定位局限于多毛上皮細(xì)胞的頂端。此外,本研究提供了在COVID-19患者中大量檢測(cè)到SARS-CoV-2并在多分枝細(xì)胞中復(fù)制的證據(jù)。研究發(fā)現(xiàn),在COVID-19的早期階段,感染的纖毛細(xì)胞迅速被分化的前體細(xì)胞取代。此外,分析表明SARS-CoV-2的細(xì)胞趨向性僅限于鼻腔纖毛上皮而非口腔鱗狀上皮。這些結(jié)果表明,在COVID-19早期階段靶向鼻上皮纖毛細(xì)胞可能是預(yù)防SARS-CoV-2傳播的理想策略。

     

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    健康供體與COVID-19患者鼻上皮細(xì)胞組成

     

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    差異表達(dá)基因分析(左); COVID-19患者鼻腔上皮細(xì)胞的軌跡推斷(右)

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