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    mRNA測序

     

    產(chǎn)品簡介

     

    轉(zhuǎn)錄組測序是通過高通量測序技術(shù)全面快速的獲得某一物種特定組織或器官在某一狀態(tài)下的幾乎所有轉(zhuǎn)錄本序列信息,包括編碼RNA和非編碼RNA,結(jié)合生物信息技術(shù)獲得RNA的表達和調(diào)控信息,檢測多種RNA的表達和變化,同時建立不同類型的非編碼RNA與mRNA之間的調(diào)控關(guān)系,探索RNA之間的相互作用,構(gòu)建潛在的RNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò),系統(tǒng)的揭示生物現(xiàn)象背后RNA世界的轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律。

     

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    技術(shù)路線圖

     

     

     

    結(jié)果展示

     

     

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    基因表達量小提琴圖(左); 樣本相關(guān)性圖(中); 差異表達基因火山圖(右)

     

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    差異基因在染色體上的分布圖(左); 差異表達模式聚類圖(中); circRNA-miRNA-mRNA網(wǎng)絡(luò)圖(右)

     

     

    送樣要求

     

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    應(yīng)用方向

     

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    應(yīng)用案例

     

     

    全轉(zhuǎn)錄組測序和蛋白組共同揭示心力衰竭關(guān)鍵表達分子和蛋白靶點

    Fibroblast-specific proteotranscriptomes reveal distinct fibrotic signatures of human sinoatrial node in nonfailing and failing hearts

    發(fā)表雜志:Circulation(IF: 29.690); 發(fā)表時間: 2021年 7月; 應(yīng)用技術(shù): 全轉(zhuǎn)錄組測序

     

    本研究采用從右心房和竇房結(jié)分離的成纖維細胞,經(jīng)體外培養(yǎng)后進行全轉(zhuǎn)錄組測序和定量蛋白組,繪制包括信使RNA、非編碼RNA(lncRNA和miRNA)和蛋白質(zhì)在內(nèi)的全面轉(zhuǎn)錄-蛋白組表達圖譜。全轉(zhuǎn)錄組測序分析,發(fā)現(xiàn)正常心臟和衰竭心臟中竇房結(jié)組織成纖維細胞的mRNA整體表達模式相似,表明二者有共同的信號通路和分子機制。正常心臟竇房結(jié)和右心房分離培養(yǎng)的成纖維細胞具有樣本特異性的差異。另外,本研究還是首次記錄人類竇房結(jié)組織成纖維細胞所特有的長鏈非編碼lncRNA。在加入TGF-β的組別比較中,miRNA在正常心臟和衰竭心臟中竇房結(jié)組織中呈現(xiàn)出明顯差別的表達模式。這項研究通過分子和蛋白質(zhì)靶點綜合圖譜,建立人心臟竇房結(jié)成纖維細胞蛋白-全轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫。這些數(shù)據(jù)可用于識別分子和蛋白質(zhì)的特征、信號通路,以及心衰患者竇房結(jié)纖維化和心律失常的潛在治療靶點。

     

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    竇房結(jié)成纖維細胞全轉(zhuǎn)錄組表達譜組成(左); 促纖維化相關(guān)的差異表達的mRNA基因(右)

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    lncRNA差異表達層次聚類熱圖分析(左); miRNA表達差異表達層次聚類熱圖(右)

     

     

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