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全外顯子組測(cè)序
產(chǎn)品簡(jiǎn)介
通過(guò)對(duì)基因組中所有外顯子區(qū)域進(jìn)行測(cè)序可以一次性確定某個(gè)體基因組全部外顯子DNA序列，即全外顯子組測(cè)序（Whole Exome Sequencing， WES） 。結(jié)合生物信息分析，檢測(cè)基因組水平上發(fā)生的變異，包括SNP、 InDel、 SV、 CNV等?；蚪M測(cè)序作為一種強(qiáng)大的研究工具，目前廣泛應(yīng)用于科學(xué)和臨床研究，其龐大的測(cè)序數(shù)據(jù)為分析個(gè)體間差異、種群演化、臨床疾病研究提供了較為全面的依據(jù)。
技術(shù)路線(xiàn)圖
結(jié)果展示
SNP統(tǒng)計(jì)（左）； 雜合性缺失分析（中）； 變異全局總覽（右）
蛋白互作網(wǎng)絡(luò)圖（左）；關(guān)聯(lián)分析曼哈頓圖（中）； 高頻基因全景突變展示圖（右）
送樣要求
應(yīng)用方向
癌癥基因組研究
腫瘤易感基因、腫瘤致病機(jī)理、腫瘤轉(zhuǎn)移/復(fù)發(fā)/異質(zhì)性；
遺傳疾病基因組研究
單基因病、罕見(jiàn)病、復(fù)雜疾病、新生突變；
藥物基因組研究
耐藥機(jī)制、靶向用藥；
人群隊(duì)列及群體進(jìn)化研究
正常人群隊(duì)列、疾病人群隊(duì)列、環(huán)境因子累積突變。
應(yīng)用案例
全外顯子組測(cè)序揭示了一種對(duì)靶向治療具有良好反應(yīng)的小細(xì)胞肺癌亞型
Whole-exome sequencing reveals germline-mutated small cell lung cancer subtype with favorable response to DNA repair-targeted therapies
發(fā)表雜志：Science Translational Medicine（IF:17.956）； 發(fā)表時(shí)間： 2021年 1月； 應(yīng)用技術(shù)： 全外顯子組測(cè)序
由于煙草是一種強(qiáng)致癌物，因此對(duì)于導(dǎo)致肺癌的次要原因的重要性常常被忽略。為了評(píng)估小細(xì)胞肺癌（SCLC） 的遺傳易感程度，本研究利用全外顯子組測(cè)序?qū)?7名患者（77 SCLC和10個(gè)肺外小細(xì)胞癌）的遺傳突變進(jìn)行了檢測(cè)，共鑒定到607個(gè)相關(guān)基因，在43.7%的病人的患者中，發(fā)現(xiàn)了35個(gè)癌癥相關(guān)基因上的42個(gè)致病突變。這些結(jié)果在79例SCLC患者的獨(dú)立隊(duì)列中得到驗(yàn)證。 14例腫瘤中有3例（21.4%） 雜合性缺失。 9名患者（10.3%） 的種系基因型影響了他們對(duì)高危家庭成員的醫(yī)療管理和檢測(cè)。與健康對(duì)照組相比，非選擇性SCLC患者更可能攜帶RAD51D、 CHEK1、 BRCA2和MUTYH致病突變，并且種系基因型與一級(jí)相對(duì)癌癥或肺癌的可能性顯著相關(guān)，而且經(jīng)過(guò)鉑類(lèi)化療后，無(wú)復(fù)發(fā)生存期更長(zhǎng)。但對(duì)于攜帶DNA修復(fù)基因致病突變的患者而言，他們的直系親屬患肺癌的概率也顯著增加。同時(shí)，他們對(duì)鉑類(lèi)藥物響應(yīng)程度更好，接受治療后的無(wú)病生存期明顯長(zhǎng)于非攜帶者。小細(xì)胞肺癌的致癌作用不僅受煙草暴露驅(qū)動(dòng)，而且還可能受種系遺傳背景的影響。研究結(jié)果確定了SCLC患者的亞型，其中種系基因型可以指導(dǎo)預(yù)后和靶向治療的選擇。
42例SCNC患者的臨床和分子特征（左）； MLH1基因上致病變異（右）
