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首頁(yè)-技術(shù)服務(wù) > MissionBio單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái) > -單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序(SNV+CNV+蛋白)
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    Mission Bio單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序(SNV+CNV+蛋白)

     

    背景介紹

     

    單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的快速發(fā)展極大地加速了生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的相關(guān)研究,幫助科研人員克服了生物樣本內(nèi)異質(zhì)性等重大挑戰(zhàn),然而先前的單細(xì)胞測(cè)序優(yōu)勢(shì)主要集中在高通量獲取單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組信息,對(duì)于高通量的捕獲基因組以及多組學(xué)信息較為欠缺。 Mission Bio Tapestri平臺(tái)可以在單細(xì)胞水平,高通量的檢測(cè)來(lái)自同一細(xì)胞的SNV、 CNV以及蛋白質(zhì)數(shù)據(jù),提供單細(xì)胞多組學(xué)解決方案,這將進(jìn)一步提高對(duì)細(xì)胞間異質(zhì)性的理解,提供細(xì)胞和遺傳組成的獨(dú)特見解。

     

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    單細(xì)胞基因組測(cè)序和傳統(tǒng)測(cè)序的區(qū)別

     

     

    技術(shù)原理

     

    Tapestri平臺(tái)采用“分子標(biāo)簽”技術(shù),基于微流控的工作原理,通過兩步油包水得以實(shí)現(xiàn)。具體流程如下:用帶有oligo標(biāo)簽的抗體對(duì)制備好的單細(xì)胞懸浮液進(jìn)行孵育,細(xì)胞表面待檢測(cè)的蛋白與抗體發(fā)生結(jié)合,然后單細(xì)胞懸液進(jìn)入Tapestri平臺(tái),通過油包水,每個(gè)油滴包裹一個(gè)細(xì)胞,實(shí)現(xiàn)細(xì)胞的分離,在油滴內(nèi)完成蛋白的釋放和細(xì)胞的裂解。然后進(jìn)行第二步油包水,此次油包水主要是在油滴內(nèi)完成對(duì)蛋白o(hù)ligo和細(xì)胞內(nèi)靶向基因的標(biāo)記,使得來(lái)自同一細(xì)胞內(nèi)的基因和蛋白均帶有相同的標(biāo)記信息。接下來(lái)油滴裂解,對(duì)帶有標(biāo)記的基因和蛋白的oligo進(jìn)行測(cè)序,從而獲取單個(gè)細(xì)胞內(nèi)基因組和蛋白質(zhì)組的信息。

     

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    抗體-寡核苷酸偶聯(lián)物用于標(biāo)記每個(gè)細(xì)胞表面

     

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    微流控技術(shù)獲取單細(xì)胞DNA&蛋白質(zhì)文庫(kù)信息

     

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    單細(xì)胞DNA+蛋白質(zhì)組學(xué)工作流程

     

     

    Mission Bio 單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序(SNV+CNV+蛋白)

     

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    結(jié)果展示

     

     

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    細(xì)胞分群圖(左); 聚類熱圖(中); 小提琴圖(右)

     

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    相關(guān)性分析(左); 突變共發(fā)生魚形圖(中); 克隆進(jìn)化分析(右)

     

    產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)

     

     

    超高通量

    可對(duì)每個(gè)樣本的5,000-10,000個(gè)細(xì)胞進(jìn)行多組學(xué)分析;

     

    平臺(tái)唯一

    目前唯一的高通量單細(xì)胞DNA(SNV、 InDel、 CNV、 LOH和易位)檢測(cè)平臺(tái),唯一的高通量單細(xì)胞DNA和蛋

    白質(zhì)聯(lián)合檢測(cè)平臺(tái);

     

    高靈敏度

    能檢測(cè)到0.1%亞克隆,即可檢測(cè)到0.1%細(xì)胞群體中發(fā)生的突變;

     

    流程簡(jiǎn)單

    工作流程簡(jiǎn)單,深度的數(shù)據(jù)分析及可視化,一鍵構(gòu)建細(xì)胞水平上突變圖譜、探索克隆分布和克隆進(jìn)化等,

    實(shí)現(xiàn)DNA和蛋白分析結(jié)果的共呈現(xiàn)。

     

    定制服務(wù)

    可選擇已有的目錄化Panel,也可根據(jù)研究需求進(jìn)行靶向DNA&蛋白質(zhì)panel定制;

     

    高性價(jià)比

    與低通量或傳統(tǒng)人工操作等方法相比,成本降低數(shù)十倍;

     

    經(jīng)驗(yàn)豐富

    百奧醫(yī)藥技術(shù)團(tuán)隊(duì)現(xiàn)已累積100余種不同組織類型、數(shù)千余個(gè)樣品的單細(xì)胞測(cè)序經(jīng)驗(yàn)。

     

    送樣要求

     

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    應(yīng)用方向

     

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    應(yīng)用案例

     

    單細(xì)胞突變分析揭示髓系惡性血液病的克隆進(jìn)化

    Single-cell mutation analysis of clonal evolution in myeloid malignancies

    發(fā)表雜志:Nature (IF: 49.962); 發(fā)表時(shí)間: 2020年 11月; 應(yīng)用技術(shù): Mission Bio 單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序(SNV+CNV+蛋白)

     

    骨髓惡性腫瘤,包括急性骨髓性白血?。ˋML) 在內(nèi),是由造血干細(xì)胞和獲得體細(xì)胞突變的祖細(xì)胞擴(kuò)展造成的。盡管bulk測(cè)序可以提供有關(guān)白血病生物學(xué)和預(yù)后的信息,但是它無(wú)法區(qū)分同一克隆中發(fā)生了哪些突變,也無(wú)法準(zhǔn)確測(cè)量克隆的復(fù)雜性或確定突變的順序。本研究通過123個(gè)患者的146個(gè)樣本的單細(xì)胞突變分析,揭示了骨髓惡性腫瘤驅(qū)動(dòng)基因的克隆結(jié)構(gòu)和進(jìn)化。研究發(fā)現(xiàn)AML由少數(shù)克隆控制,在表觀遺傳調(diào)控因子中經(jīng)常發(fā)生共突變。然而,信號(hào)基因的突變通常頻繁發(fā)生在不同的亞克隆中,這與克隆多樣性的增加是一致的。本研究描繪了每個(gè)樣本的克隆軌跡和發(fā)現(xiàn)了協(xié)同促進(jìn)克隆擴(kuò)展和控制的突變組合,并將蛋白質(zhì)表達(dá)與突變分析相結(jié)合,揭示了體細(xì)胞基因型和具有免疫表型的克隆結(jié)構(gòu)。為了解髓樣轉(zhuǎn)化的發(fā)病機(jī)理以及克隆復(fù)雜性如何隨疾病進(jìn)展而發(fā)展提供了視角。

     

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    髓系惡性腫瘤患者的單細(xì)胞DNA測(cè)序結(jié)果

     

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    AML代表性的遺傳軌跡(左); 蛋白表達(dá)與基因突變關(guān)聯(lián)(右)

     

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