新品發(fā)布
高通量測(cè)序(NGS)技術(shù)因通量高、速度快等優(yōu)勢(shì)在基因檢測(cè)中的應(yīng)用越來越廣泛,在基礎(chǔ)研究和臨床輔助診斷方面發(fā)揮了巨大作用,NGS實(shí)驗(yàn)流程包括核酸提取、文庫構(gòu)建、上機(jī)測(cè)序、數(shù)據(jù)分析等步驟,其中文庫構(gòu)建是非常關(guān)鍵的一環(huán),對(duì)整個(gè)實(shí)驗(yàn)結(jié)果影響最大。
為滿足市場(chǎng)需求,百奧醫(yī)藥在積累大量二代測(cè)序相關(guān)實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn)基礎(chǔ)上,自主研發(fā)了二代測(cè)序mRNA和DNA建庫系列試劑盒,可廣泛應(yīng)用于二代測(cè)序等相關(guān)科學(xué)研究實(shí)驗(yàn)。
百奧醫(yī)藥mRNA建庫試劑盒
一、產(chǎn)品介紹
百奧醫(yī)藥mRNA建庫試劑盒(Cat.BA3105)是針對(duì)高通量測(cè)序平臺(tái)專門研發(fā)的用于mRNA轉(zhuǎn)錄組文庫構(gòu)建試劑盒。本試劑盒適用于起始量在10ng-1ug之間完整度良好的動(dòng)植物和真菌等真核生物的Total RNA 。Total RNA樣品經(jīng)過mRNA分離、mRNA片段化、cDNA合成、末端修復(fù)和加A、接頭連接、連接產(chǎn)物純化和片段大小分選、文庫擴(kuò)增等步驟,最終得到適用于Illumina平臺(tái)的測(cè)序文庫。本試劑盒利用磁珠分選的方式,可以快速獲得特定長度的文庫,能夠滿足不同實(shí)驗(yàn)的個(gè)性化需求。
產(chǎn)品貨號(hào) |
產(chǎn)品名稱 |
產(chǎn)品規(guī)格 |
儲(chǔ)藏條件 |
BA3305 |
百奧醫(yī)藥mRNA建庫試劑盒(Module II) |
24rxns |
-20℃避光保存 |
二、應(yīng)用領(lǐng)域
基因表達(dá)分析;單核苷酸變異分析;剪切變異體分析;基因融合鑒定。
三、測(cè)試效果
文庫產(chǎn)出:從動(dòng)物(293T細(xì)胞)、植物(擬南芥)、真菌(酵母)中提取Total RNA后,分別以1ug、100ng、10ng的起始量,使用百奧醫(yī)藥mRNA建庫試劑盒(Cat:BA3105)和目前廣泛應(yīng)用的N*公司進(jìn)口mRNA建庫試劑盒構(gòu)建文庫。由結(jié)果看出,相同循環(huán)數(shù)下使用百奧醫(yī)藥mRNA建庫試劑盒的文庫產(chǎn)出好于對(duì)標(biāo)品,尤其在低起始量下優(yōu)勢(shì)更大。
數(shù)據(jù)產(chǎn)出質(zhì)量:以1μg的293T細(xì)胞Total RNA起始,分別以百奧醫(yī)藥mRNA建庫試劑盒(Cat:BA3105),N*公司的mRNA試劑盒,以及國內(nèi)V*公司的mRNA試劑盒構(gòu)建文庫,質(zhì)控后的文庫用Illumina NovaSeq 6000測(cè)序。從下機(jī)數(shù)據(jù)分析結(jié)果看,與同類試劑盒產(chǎn)品對(duì)標(biāo),百奧醫(yī)藥mRNA建庫試劑盒整體表現(xiàn)出色,尤其在比對(duì)率和基因檢出數(shù)上優(yōu)勢(shì)更大。
表1 百奧醫(yī)藥、N*公司以及V*公司mRNA建庫試劑盒構(gòu)建的文庫測(cè)序數(shù)據(jù)對(duì)比
基因表達(dá)一致性:整理百奧醫(yī)藥mRNA建庫試劑盒(Cat:BA3105),N*公司的mRNA試劑盒,以及V*公司的mRNA試劑盒構(gòu)建的文庫基因表達(dá)數(shù)據(jù),然后進(jìn)行相關(guān)性分析,從結(jié)果看出,百奧醫(yī)藥mRNA建庫試劑盒構(gòu)建的文庫產(chǎn)出的基因表達(dá)數(shù)據(jù)與市面上同類產(chǎn)品重復(fù)極好。
百奧醫(yī)藥DNA建庫試劑盒
一、產(chǎn)品介紹
百奧醫(yī)藥DNA建庫試劑盒(Cat.BA3106)是針對(duì)Illumina高通量測(cè)序平臺(tái)定向研發(fā)的建庫試劑盒。本產(chǎn)品適用100 pg - 1μg 起始DNA,包含常規(guī)動(dòng)植物基因組、微生物基因組、FFPE、cfDNA、ChIP DNA 等樣本。試劑盒中的每種試劑都經(jīng)過了嚴(yán)格的質(zhì)量控制,且每一批次的建庫 Kit 都經(jīng)過了建庫和上機(jī)測(cè)序的驗(yàn)證,保證每一批次的試劑盒性能質(zhì)量穩(wěn)定。
產(chǎn)品貨號(hào) |
產(chǎn)品名稱 |
產(chǎn)品規(guī)格 |
儲(chǔ)藏條件 |
BA3106 |
百奧醫(yī)藥DNA建庫試劑盒 |
24rxns |
-20℃避光保存 |
二、 應(yīng)用領(lǐng)域
全基因組測(cè)序;全外顯子或靶向捕獲測(cè)序;擴(kuò)增子測(cè)序;免疫共沉淀測(cè)序;宏基因組測(cè)序
三 、測(cè)試效果
文庫產(chǎn)出:以239 T細(xì)胞片段化DNA為樣本進(jìn)行建庫,DNA起始量分別為100 pg、1 ng、100 ng和1 μg,分別以百奧醫(yī)藥DNA建庫試劑盒(Cat:BA3106)和N*公司DNA建庫試劑盒構(gòu)建文庫。由結(jié)果可知,對(duì)于不同起始量DNA,百奧醫(yī)藥DNA建庫試劑盒在相同擴(kuò)增循環(huán)數(shù)下文庫產(chǎn)出均高于對(duì)標(biāo)品。
數(shù)據(jù)覆蓋度:分別以起始量1ug的DNA標(biāo)準(zhǔn)品NA12878和GW-OGTM800為樣本進(jìn)行建庫,分別使用百奧醫(yī)藥DNA建庫試劑盒(Cat:BA3106)和N*公司DNA建庫試劑盒構(gòu)建文庫。質(zhì)控后的文庫用Illumina NovaSeq 6000測(cè)序,對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)量進(jìn)行均一化,分析結(jié)果顯示,百奧醫(yī)藥DNA建庫試劑盒構(gòu)建的文庫去重后的測(cè)序深度更高。